第1集@@@@TheMemoriesintheShallowGrave真人CS场地发现一具尸骨，是一位最近半年来一直在失忆恍惚走失中度过的女性，她没有死于丈夫的家暴，也没有死于流浪走失，却死在精神医生之。。BB坚持轮流居住在对方的家里，坚决不同居。不过面对bones的大肚子，booth觉得是时候改变了。bones虽然大腹便便但还是事事亲力亲为，只是荷尔蒙让她怪异非常。booth趁机拍下她的各种囧事。当然bones最终?通了，决定让步。||第2集@@@@TheHotDogintheCompetitioncam找来一位十八岁的少年天才实习，显然这个孩子不是个省油的灯。一名女性死在出租公寓的蟒蛇保温箱里，她是一名大胃王选手，怀孕让她萌生退意。结案后，BB坐在沙发上开心的观看宝宝的B超影片。||第3集@@@@ThePrinceinthePlastic两个古董淘宝者在垃圾堆里发现了一具被塑料薄膜包裹着的女尸，薄膜不仅包着尸体，还有一个玩具——白马王子。经过Cam等人的检查，证明尸体是窒息而死，且身上有多处骨折。玩具上的指纹证实尸体的身份是DebraCortez,是一家叫Dillio的玩具公司的创意主管，她所设计的玩具是市场中畅销产品。Debra有一个秘密情人BrockVorback，是一名退役军人，现在靠扮演白?王子谋生，Brock建议Debra单干，但是公司里一名主管不希望她离开，于是用工作车间的卷帘门压死了Debra。小甜甜一直要求可以配枪，最后他通过测试如愿获得了许可。Bones陪着Angela去组装Michael 的玩具,Bones买了两把打海绵球的玩具枪，和Booth玩得很开心。||第4集@@@@TheMaleintheMail在邮局的“死信办公室”里发现一具被分别装在6个用专业手法包装的纸箱盒里的男尸。同时Booth的爷爷告诉了他一件事情：Booth的父亲去世了。Bones和Cam等人想要安慰他，但是Booth一直逞强说没事。Angela通过追查包装上的二维码，查到被打包的尸体来自马里兰州海尔茨维尔的一家Ship&Print公司，是一名叫OliverLawrence的员工，死者和公司的四名员工合买了一张彩票，中了6000万美元，但是Lawrence没有拿到属于他的钱，其他四名员工分走了奖金，各奔东西。但这都不是Lawrence的死因，公司里的一名新进员工利用货运买卖毒品被Lawrence发现，于是他用胶带枪杀死了Lawrence。Booth的爷爷把一个装有他父亲的遗物转的盒子给了他，Bones鼓励Booth打开盒子，因为Booth脑海中仍然有和父亲的美好回忆。Booth打开盒子看着儿时和父亲的合影照片、比赛票根等，泪流满面。||第5集@@@@TheTwistintheTwister两名露营地工作者在露营地发现了一具30出头的男性尸体，Booth对Bones的过度保护让现场的FBI无语。而Angela和Hodgins被Michael折腾的已经几周没有睡过好觉，Angela的摇滚老爹又跑来添乱。Cam等人证实尸体可能是被一场龙卷风抛在了露营地，这是Bones第一次遇到和龙卷风相关的案子，因而对此十分感兴趣。尸体是一个名叫ScottBraley的追风族，Scott有一辆价值10万的组装货车，Booth骗Bones去买肥皂实际上是和小甜甜去追查一个电影摄制组，但是Bones自己开车跟过来，正好遇上一场龙卷风。摄制组里有一个酷爱彩虹的成员，而Hodgins发现了凶器是一个彩虹水瓶。彩虹女的男友是摄影师，摄影师撒谎案发那天没有和死者一起，但是Bones通过案发的龙卷风是顺时针方向的特征戳穿了谎言。原来摄影师和彩虹女是情人，但是彩虹女和Scott上床忘记拿走她的水瓶，摄影师看到后一气之下砸死了Scott。Michael在Angela的摇滚父亲放的摇滚乐中安然入睡，解决了两人几周以来的问题。Booth也和Bones对于过度保护的问题坦诚相?，得到了双方的谅解。||第6集@@@@TheCrackintheCode国立纪念馆出现了谋杀现场，凶手留下的重新排列的脊椎骨暗藏了密码消息。凶手是精通科技技术的高智商连环罪犯（在骨头上刻下恶意程序，根本没有用电子产品就毁掉了杰弗逊研究所价值一百万美金的电脑系统）。本集中BB找到了满意的房子。||第7集@@@@ThePrisonerinthePipe斜眼小分队调查在下水道中发现的碎骨，受害人是逃犯，但最终得出的结论是受害人已经在监狱中被杀害，然后碎尸冲走。最终BB抓住了罪犯，也以一种极其意想不到的方式迎来了自己的孩子。||第8集@@@@TheBumpintheRoad在特别探员GennyShaw的帮助下，杰斐逊学院研究小组鉴定出一具人体遗骸的真实身份：此人是个廉价商品购物狂，极度迷恋各种优惠券和礼券。当人们发现他时，他的尸骸正被一辆18轮重型卡车拖着到处跑。与此同时，Brennan正式结束产假返回工作岗位，但这对她来说注定是难熬的一天。Cam不同意女儿与实习助手FinnAbernathy交往。||第9集@@@@ 有人在垃圾堆里发现了一具尸体，尸身染满了一种蓝色的物质。实习助手Arastoo Vaziri发明了一种方法来消除尸体解剖对尸身造成的破坏，帮助杰斐逊团队找到受害人生前工作的地方－－一家美发屋。与此同时，Brennan对自己生孩子以后的体型感到不满意，Booth决定做点「特别的事情」来帮助Brennan提升自信心。||第10集@@@@TheWarriorintheWuss某运输公司一名职员的尸体在密林深处被人找到，办案人员很快怀疑受害人的儿子有重大作案嫌疑。Booth和Brennan决定到受害人的儿子参加的空手道培训班上去寻找「作案动机」。杰斐逊学院实验室里，Hodgins对某些「新型实验装备」产生强烈兴趣，几乎到痴迷的程度。Booth和前妻所生的儿子Parker从英国回到美国，Brennan不免有些担心－－他对刚刚出生的小妹妹Christine是什么态度？||第11集@@@@TheFamilyintheFeud森林中的某处惊现一具尸体，证据显示受害人与两个相互仇恨的家族有关系。这可不是一般的仇恨－－这段「血海深仇」已延续了整整一个世纪！Brennan和Booth讯问了其中一个家族的成员，得到了令人震惊的消息，而这些消息有助于他们查清这起谋杀案的前因后果。与此同时，Brennan和Booth都没有时间照顾刚出生不久的女儿，Brennan的父亲主动提出为他们带孩子。回想?自己童年时的不幸遭遇，Brennan对父亲的好意充满戒心。||第12集@@@@TheSuitontheSetBrennan的新书就要被拍成电影了……制片方称这部名为《争端》（BoneofContention）的电影完全忠于Brennan的书及杰斐逊学院团队的日常工作，事实是这样吗？无论如何，Brennan和Booth接受了制片方的邀请，前往好莱坞对拍摄工作提供指导性建议。到了拍摄现场之后，Brennan很快对演员的表演提出了质疑，认为他们「漏洞百出」，「完全不符合实际」－－更不用说这部电影完全不尊重科学的事实了！正当Brennan生气的时候，她赫然发现用来充当道具的干尸竟然是一具真尸体，受害人是被谋杀的。在好莱坞这块「绣捀就是一切」的土地上，Booth和Brennan展开一场货真价实的调查行动。毕竟这是现实世界！与此同时，Booth在拍摄场地上获得一份意外的「工作邀请」，而Cam过去的某些情况第一次曝光（这让她很难堪）。||第13集@@@@ThePastinthePresent在季终集里，邪恶的科技天才ChristopherPelant再次出现，并因为Booth和Brennan之前调查过的一起案件而出庭受审。Booth和Brennan知道他神通广大，于是反
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